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Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  44 lines
  1. ********************************************
  2. * Thiamine pyrophosphate enzymes signature *
  3. ********************************************
  4.  
  5. A number of enzymes  require  thiamine  pyrophosphate  (TPP) (vitamin B1) as a
  6. cofactor.  It has been shown [1] that  some  of these enzymes are structurally
  7. related. These related TPP enzymes are:
  8.  
  9.  - Pyruvate oxidase (POX) (EC 1.2.3.3)
  10.    Reaction catalyzed: pyruvate + orthophosphate + O(2) + H(2)O = acetyl
  11.    phosphate + CO(2) + H(2)O(2).
  12.  - Pyruvate decarboxylase (PDC) (EC 4.1.1.1)
  13.    Reaction catalyzed: pyruvate = acetaldehyde + CO(2).
  14.  - Indolepyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.74) [2]
  15.    Reaction catalyzed: indole-3-pyruvate = indole-3-acetaldehyde + CO(2).
  16.  - Acetolactate synthase (ALS) (EC 4.1.3.18)
  17.    Reaction catalyzed: 2 pyruvate = acetolactate + CO(2).
  18.  - Benzoylformate decarboxylase (BFD) (EC 4.1.1.7) [3]
  19.    Reaction catalyzed: benzoylformate = benzaldehyde + CO(2).
  20.  
  21. As  a signature pattern for these enzymes we  have selected a conserved region
  22. which is located in their C-terminal section.
  23.  
  24. -Consensus pattern: [LIVMF]-[GSA]-x(5)-P-x(4)-[LIVMF]-x-[LIVMF]-x-G-D-[GSA](2)
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  26.  for Hanseniaspora uvarum and maize PDC.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: a hypothetical  protein in the  puf
  28.  phothosynthesis operon of Rhodobacter capsulatus; this protein could be a TPP
  29.  enzyme.
  30.  
  31. -Note: other TPP enzymes  such as the E1  component of pyruvate  dehydrogenase
  32.  complex, 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate  synthase, and
  33.  transketolase do not seem to be related to the above enzymes.
  34.  
  35. -Last update: June 1994 / Text revised.
  36.  
  37. [ 1] Green J.B.A.
  38.      FEBS Lett. 246:1-5(1989).
  39. [ 2] Koga J., Adachi T., Hidaka H.
  40.      Mol. Gen. Genet. 226:10-16(1991).
  41. [ 3] Tsou A.Y., Ransom S.C., Gerlt J.A., Buechter D.D., Babbitt P.C.,
  42.      Kenyon G.L.
  43.      Biochemistry 29:9856-9862(1990).
  44.